Савез студената
Савез студената Универзитета је самостална, интересна, ванстраначка организација коју чине савези студената факултета Универзитета у Нишу, основана са циљем да штити права и интересе студената. Савез студената Универзитета у Нишу (ССУН) је најстарија студентска организација на просторима јужне Србије, формирана 1965. године. Током деведесетих година Савез студената је био јединствено и једино представничко тело студената на Универзитету и факултетима, а крајем те деценије имао је одлучујућу улогу у актуелним друштвеним променама (студентски протести 96/97 и 98). Тада су се, у духу промена друштва, јавиле и прве тенденције разједињавања студентских снага, стварањем нових студентских групација на Универзитету.
Данас је ССУН најмасовнија студентска организација која окупља и афирмише студенте кроз друштвено користан рад, културно-уметничке и спортске активности, Савез студената УН је достигао завидан степен развијености организационе структуре. Основни принципи рада Савеза студената су јавност и демократичност, уз сарадњу са сродним организацијама и удружењима у земљи и иностранству. Активности Савеза студената обухватају и низ културних и научних трибина, књижевних вечери и спортских такмичења, а посебна пажња се поклања месту и улози Универзитета и његових студената у Европи и свету.
Савез студената је организатор више традиционалних студентских културноуметничких и спортских манифестација какве су Бруцошијада, Светосавски бал, обележавање Дана студената, посета Зејтинлику (обележавање пробоја Солунског фронта).
Савез студената је током свога рада оснивао разне секторе, како би активности учинио ефикасним и плодоноснијим. Многи од тих сектора данас постоје као самосталне организације које такође окупљају велики број студената. Неке од тих организација су: Универзитетски спортски савез, Студентски информативни издавачки центар, Здравствено потпорно удружење итд.
Студентска унија
Студентска унија Универзитета у Нишу (СУУН) основана је крајем 2001. године са намером да се постојеће локалне уније Универзитета у Нишу, основане на појединим факултетима до 1998. године, повежу у свом раду, да постоји координација на нивоу Универзитета и да се рад прошири и на остале факултете оснивањем нових унија. Огранци ове организације постоје на Економском и Филозофском факултету.
Студентска асоцијација
Студентска Асоцијација Универзитета у Нишу је независна, добровољна, нестраначка и самостална организација студената нишког Универзитета. Циљ Студентске асоцијације је остваривање начела садржаних у Програму Асоцијације која гарантују промоцију и борбу за интересе и права студената. Нишка Студентска Асоцијација-НиСА званично је формирана у фебруару 2001. године, и то од стране Савеза студената Машинског, Медицинског, Природно-математичког, Филозофског и Савеза студената Факултета за физичку културу, као и независних студентских организација на Електронском и Грађевинско-архитектонском факултету. Сада Студентска асоцијација има огранке на Медицинском и Грађевинско-архитектонском факултету.
