Универзитет у Нишу ради у једној од најрепрезентативнијих грађевина у граду, згради подигнутој крајем 19. века, која је 1979. године проглашена културним добром од великог значаја.
У центру града, на десној обали Нишаве, изграђена је далеке 1887. године за потребе тадашњег Окружног начелства. Монументална грађевина подигнута је у неоренесансном стилу, по пројекту непознатог бечког архитекте и у својој дугој историји била је седиште Суда, Начелства и Капетаније, а од 26. јула 1914. до 6. октобра 1915. године (када је Ниш био ратна престоница Србије) место кабинета Владе и Министарства иностраних дела. Ту је 28. јула 1914. године примљен телеграм којим је Аустроугарска објавила рат Србији.
Године 1930. зграда постаје административно седиште Моравске бановине, после II светског рата седиште Среза, а од 1967. године је уступљена на трајно коришћење Универзитету у Нишу.
Универзитет у Нишу је 2007/08. године, обележавајући 120 година зграде Универзитета, први пут, уз одговарајућу санацију објекта и прилагођавање простора, обезбедио потребну приступност свим просторијама у згради Универзитета за лица са инвалидитетом.
